有关qsub在Linux下的使用指南 (qsub linux)
在Linux环境下，有许多工具和命令可用于提升工作效率和计算速度。其中，qsub是一款使用广泛的命令行工具，可帮助用户将计算任务提交到集群系统中进行处理。本文将介绍qsub在Linux下的具体使用指南，帮助读者更好地掌握和使用该工具。
一、qsub的基本介绍
qsub全称为”Queue Submitter”，是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中，等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用，是高性能计算集群中提交任务的标准方式之一。
二、qsub的安装与配置
如果您的系统中已经安装了SGE集群管理软件，则qsub命令已经包含在其中。如果没有安装，可以通过以下命令进行安装：
sudo apt-get install gridengine-client
安装完成后，需要进行相关配置。具体步骤如下：
1. 配置集群管理器
在集群中安装SGE集群管理软件后，需要执行以下命令来配置SGE：
sudo /usr/share/gridengine/util/install_modules/install_modules_local
安装完成后，需要启动SGE服务：
sudo service gridengine-master start
2. 配置qsub
安装完SGE集群管理软件后，可以使用qsub命令来执行计算任务。在使用qsub之前，需要进行以下配置：
（1）创建一个工作目录，在其中创建一个脚本文件。脚本文件中包含要执行的命令和参数。
（2）在脚本文件的开头写入#!/bin/bash，表示这是一个shell脚本。
（3）在脚本文件中添加作业控制参数，如#BSUB命令、#PBS命令等。
（4）将脚本文件命名为job.sh并保存在工作目录中。
（5）使用qsub命令将任务提交到集群系统中。
三、qsub的使用
1. 命令格式
qsub [-ACdfklmnpqtTv] [-@ 条件] [-a 开始时间] [-A 账户] [-b y/n] [-c n] [-C 目录] [-cwd] [-e 错误文件] [-h] [-I] [-j y/n] [-js 脚本] [-l 资源] [-m y/n] [-M 邮件地址] [-N 作业名称] [-o 输出文件] [-p 优先级] [-P 项目] [-r y/n] [-S 解释器] [-u 用户] [-v 环境变量] [-V] [-w 类型] [-W 等待时间] [-x] [脚本]
2. 常用参数
（1）-l 资源：指定作业执行要求的资源，如使用节点数、CPU数量、内存大小等。
（2）-N 作业名称：指定作业的名称，方便管理和查找。
（3）-o 输出文件：指定标准输出文件的名称。
（4）-e 错误文件：指定标准错误输出文件的名称。
（5）-p 优先级：指定作业执行的优先级。
（6）-q 主机名：指定要使用的计算节点。
（7）-S 解释器：指定作业使用的解释器。
（8）-V：将环境变量传递给脚本中的程序。
四、qsub的示例
下面给出一个qsub的使用示例，该示例中，我们将使用qsub命令将一个简单的程序提交到集群系统中执行。
1. 创建一个工作目录，将以下脚本保存为job.sh：
#!/bin/bash
#$ -N test
#$ -cwd
#$ -l nodes=1:ppn=8
echo “hello, world!”
以上脚本表示，我们将创建一个名为test的作业，要求使用1个节点和8个CPU核心，使用默认的工作目录并输出”hello, world!”。
2. 使用qsub命令提交作业并查看执行结果：
qsub job.sh
qstat -u [username]
以上命令将作业提交到集群系统中，并使用qstat查看执行结果。如果作业执行成功，将在标准输出文件中输出”hello, world!”。
五、
通过本文的学习，我们了解了qsub在Linux环境下的相关知识和使用指南。在实际工作中，qsub将为用户提供便捷的计算任务提交方式，极大地提高了工作效率和计算速度。希望读者们能够深刻理解并掌握qsub命令的使用方法，从而更好地利用Linux环境中的优秀工具。
相关问题拓展阅读：
Linux/超算中PBS常用命令
新手，纯纯搬运工【出处引用自：
】
1. Linux常用命令
最常用：
ls（英文全拼：list files）：列出目录及文件名
ls -l：列出目录及文件名，可查看更多
ls -al：可以看到隐藏文件
cd（英文全拼：change directory）：切换目录
cd .. ：返回上一级
cd
文件夹
名：进入目录
pwd（英文全拼：print work directory）：显示目前的目录
mkdir 文件夹名（英文全拼：make directory）：创建一个新的目录
rmdir 文件夹名（英文全拼：remove directory）：删除一个空的目录
cp （英文全拼：copy file）: 复制文件或目录
mv （英文全拼：move file）: 移动文件或目录，或修改文件或目录的名称
rm（英文全拼：remove）: 删除文件
rm -r 文件夹名：递归删除某目录
clear：清空terminal的所有内容（或者使用Ctrl+L）
tab按键：补充完整文件名或文件夹名
次常用：
vim/vi 某文件 （编辑文件）
nano 某文件 （编辑文件）
touch 文件 （新建空文件）
sudo -s （切换到root模式磨桥姿）
exit （退出root模式等）
sudo chmod -R 755 文件名/文件夹名 （获取文件/文件夹的755权限）
chown （改变文件或目录的所有者）
chgrp （改变文件或目录的所属组）
make （编译成.exe）
解压/解包：
tar文件 （注：tar是打包，不是压缩！）
解包：tar xvf FileName.tar
打包：tar cvf FileName.tar DirName
.gz文件
解压1：gunzip FileName.gz
解压2：gzip -d FileName.gz
压缩：gzip FileName
.
tar.gz
和 .tgz文件
解压：tar zxvf FileName.tar.gz
压缩：tar zcvf FileName.tar.gz DirName
安装和卸载deb软件包：
安装：sudo dpkg -i deb文件
查看：sudo dpkg -l
卸载：sudo dpkg -r 软件名
参考资料：
Linux 教程
Linux常用命令
linux中tar命令的用法
全瞎绝网最全Linux命令总结
2. vim/vi里的操作
:q 退出
:wq 保存并退出
:w 保存
:q! 强行退出（不保存退出）
:w! 强行保存
i 进入编辑，转为输入模式（光标前面）
a 进入编辑，转为输入模式（光标后面）
o 进入编辑，转为输入模式（光标下方新建一行）
Esc 退消肆出i（插入）命令
3. 超算中PBS常用命令
pbsnodes （查看所有节点）
pbsnodes -l free （查看空闲节点）
pbsnodes 某节点 （查看某节点状态）
.sh
某节点 （转到某节点）
exit （离开节点）
qsub 文件名.pbs/sh （提交任务）
qstat （列出状态）
qstat -q （列出队列）
qstat -n （列出队列中使用的节点）
qstat -f jobid （查看jobid任务的详细信息）
qdel jobid （取消任务）
4. 其他
（1）Linux开机自启
sh文件中包含：
#!/bin/bash#chkconfig:#description:auto_run
sh文件移动到/etc/init.d后，分别输入命令：
chkconfig –add .sh
chkconfig –list
chkconfig .sh on
service .sh start
参考资料： linux 开机启动 .sh 文件 – 自己的太阳 – 博客园
（2）Linux
环境变量
方法1：临时使用环境变量：export PATH=”/home/www/anaconda3/bin:$PATH”
方法2：修改.bashrc文件
参考资料： Linux PATH 作用以及查看和修改方法_haozhepeng的专栏
（3）两个sh文件
a.sh文件（用于提交任务，执行a.py文件）
#!/bin/sh#PBS -N task#PBS -l nodes=1:ppn=1#PBS -q scorecd $PBS_O_WORKDIRexport OMP_NUM_THREADS=1python a.py
a.sh文件（用于提交任务，执行a.
exe文件
）
#!/bin/sh#PBS -N task#PBS -l nodes=1:ppn=1#PBS -q scorecd $PBS_O_WORKDIRexport OMP_NUM_THREADS=1./a.exe
（4）一个makefile文件
makefile文件（用于编译Fortran文件）
INC := -I/public/software/compiler/intel/composer_xe_2023.2.164/mkl/include/intel64/lp64
LIB := -L/public/software/compiler/intel/composer_xe_2023.2.164/mkl/lib/intel64
mpi:= -I/public/software/mpi/mpich/3.1.4/intel/include /public/software/mpi/mpich/3.1.4/intel/lib -lmpich -limf -lsvml -lintlc
src:=Console1exec:=a
all: $(src).f90
Linux集群使用命令
存储NAS 文件操作
df -h查看空间使用情况
警惕超大 nohup.out
任务提交
任务提交前
qhost–查看集群负载状态
qsub / qsub-sge.pl–提交茄逗任务
qstat–查看任务状态
qdel / qmod–任务控制
任务查看
qhost -j—列出所有用户在每个节点上的任务
qhost -q—列出每个节点上每个队列的任务数
qhost -u username—列出某个用户在每个节点上的任务
提交命令
qsub -cwd -q queue.q test.sh
qsub-sge.pl –maxproc 50 –resource vf=5G –queue queue.q test.sh
任务查看2
qstat -u username—查看某个用户的任务
qstat -u *,—查看所有用户的任枯纳告务
qstat –j jobs_ID—查看某个任务的详细信息
查看.e和.o文件
.e：错误信息
.o：标准输出
任务控制
qdel jobID—删除某个任务
qdel -u username—删除某个用户的所有任务
qmod -s jobID–挂起某个任务
qmod -us jobID—继续运行某个挂起的任务
按任务占用内存大小选择相应的队列
查看队列 qstat -g c
QUEUE
PE.q–并行
cloud.q–云平台
general.q–96G节点
middle.q–96G节点
great.q–大内存节点
plus.q–大内存节点
single.q–Trinity组装
single._p.q—Trinity组没明装（占用内存较大）
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红旗Linux. bash：qsub：command not found，该怎么解决
——解兆档决方案——
——解决方族戚乱仔咐案——
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