Linux操作系统下如何使用R语言连接Oracle数据库 (linux下r连接oracle)

R语言是一种功能强大的统计分析软件,其在数据分析和可视化方面有着广泛的应用。然而,在实际应用中,我们需要与各种不同形式的数据源进行交互,而连接数据库是最常见的需求之一。在此篇文章中,我们将详细地说明如何在Linux操作系统上使用R语言连接Oracle数据库。

1. 下载Oracle Instant Client

在开始使用R语言连接Oracle数据库前,我们需要下载Oracle Instant Client,这是一个轻量级的Oracle客户端,其占用空间很小且易于安装和配置。在下载Oracle Instant Client时,请确保选择正确的平台和版本。在本教程中,我们将以Ubuntu Linux 18.04为例进行说明:

“`

$ wget https://download.oracle.com/otn_software/linux/instantclient/1912023/instantclient-basiclite-linux.x64-19.12.0.0.0dbru.zip

$ unzip instantclient-basiclite-linux.x64-19.12.0.0.0dbru.zip -d /opt/oracle

“`

将Oracle Instant Client解压到/opt/oracle目录下,完成后执行以下命令:

“`

$ echo /opt/oracle/instantclient_19_12 > /etc/ld.so.conf.d/oracle-instantclient.conf

$ ldconfig

“`

这将告诉系统Oracle Instant Client的位置,使得R语言后续能够正确地使用它。

2. 安装ROracle

接下来,我们需要安装ROracle,这是一个R语言官方推荐的数据库驱动。安装ROracle需要依赖于Oracle Instant Client,因此请确保您已经按照上述步骤正确安装。此外,您需要在系统中安装Oracle数据库的头文件和库文件。

在Ubuntu Linux系统中,您可以使用以下命令来安装这些文件:

“`

$ sudo apt-get install libo1 libo-dev

“`

在安装完依赖项后,您可以使用以下命令来安装ROracle:

“`

$ R CMD INSTALL –configure-args=’–with-oci-lib=/opt/oracle/instantclient_19_12 –with-oci-inc=/opt/oracle/instantclient_19_12/sdk/include’ ROracle_VERSION.tar.gz

“`

其中,ROracle_VERSION.tar.gz表示ROracle的版本号,您需要将其替换为您下载的版本号。此外,–with-oci-lib和–with-oci-inc参数表示Oracle Instant Client所在的目录,您需要确保这些参数与您的实际目录一致。

如果您成功安装了ROracle,您可以使用以下命令来测试连接Oracle数据库:

“`

> library(ROracle)

> drv

> con

> dbGetQuery(con, “SELECT * FROM TABLE_NAME”)

“`

其中,USERNAME和PASSWORD表示您的Oracle数据库的用户名和密码,HOSTNAME和PORT表示您的Oracle数据库所在的服务器和端口,DBNAME表示您要连接的Oracle数据库的名称,TABLE_NAME表示您要查询的表名。如果您成功执行这些代码,就说明您已经成功连接了Oracle数据库并获取了查询结果。

3.

在本篇文章中,我们详细介绍了如何在Linux操作系统下使用R语言连接Oracle数据库。我们首先下载了Oracle Instant Client,然后安装了ROracle,并最终成功连接了Oracle数据库并获取了查询结果。希望本篇文章可以帮助到您,让您更加轻松地使用R语言进行数据分析和可视化工作。

相关问题拓展阅读:

用linux 是终端怎么连接到已经装好的oracle数据库,像在windows的doc下一样

用sqlplus命令可以连接到oracle数据库。与windows下doc连接方式是一样的。

sqlpl user orcl/lin@dbname dbname换成你的数据库名

安装陵如用户执行 sqlplus user/passwd@dbname 或者执蚂汪段行sqlplus “闷誉/ as sysadb”

怎么在linux上安装oracle

方法/步骤

检查硬件是否满足要求

1)确保系统有足够的 RAM 和交换空间大小,运行以下命令:

#grep MemTotal /proc/meminfo

#grepSwapTotal /proc/meminfo

注:所需最小 RAM 为 512MB,而所需最小交换空间为 1GB。对于 RAM 小于或等于 2GB 的系统,交换空间应为 RAM 数量的两倍;对于 RAM 大于 2GB 的系统,交换空间应为 RAM 数量的一到两倍。

2)确保有足够的磁盘空间。Oracle 10g软件大约需要 2.5GB 的可用磁盘空间悉颤蚂,数据库则另需至少1.2G的磁盘空间

3)/tmp 目录至少需要 400MB 的可用空间。

要检查系统上的可用磁盘空间,运行以下命令:

#df-h

检查系统是否已安装所需的开发包

使用rpm -qa命令,确保以下包已成功安装。对于包的版本,只有版本高于下面的都可以,如果低于此版本,则要升级处理,如下:

binutils-2.15.92.0.2-13.EL4

compat-db-4.1.25-9

compat-libstdc++-296-2.96-132.7.2

control-center-2.8.0-12

gcc-3.4.3-22.1.EL4

gcc-c++-3.4.3-22.1.EL44

glibc-2.3.4-2.9

glibc-common-2.3.4-2.9

gnome-libs-1.4.1.2.90-44.1

libstdc++-3.4.3-22.1

libstdc++-devel-3.4.3-22.1

make-3.80-5

pdksh-5.2.14-30

sysstat-5.0.5-1

xscreensaver-4.18-5.rhel4.2

setarch-1.6-1

libaio-0.3.103-3

创建oracle组和oracle用户

创建用于安装和维护 Oracle 10g软件的 Linux 组和用户帐睁埋户。用户帐户将称为 oracle,而组将称为 oinstall(用于软件安装) 和 dba(用于数据库管理)。

#groupadd oinstall

#groupadd dba

#useradd -m -g oinstall -G dba oracle –poracle (p表示添加帐号密码)

创建oracle目录并改变目录权限

现在,创建存储 Oracle 10g 软件和数据库文件的目录。本指南在创建目录结构时所用的洞樱命名惯例符合更佳灵活结构 (OFA) 规范。

以 root 用户身份执行以下命令:

#mkdir -p /u01/app/oracle# oracle根目录,-p 表示递归建立目录

#mkdir -p /u02/oradata # oracle数据文件存放目录

#chown -R oracle:oinstall /u

#chown -R oracle:oinstall /u02

#chmod -R 775 /u01

#chmod -R 775 /u02

配置linux内核参数

#vi/etc/sysctl.conf,添加如下内容:

kernel.shmall =

kernel.shmmax =#此处默认设置为2G,数值一般设为物理内存的40~50%

kernel.shmmni = 4096

kernel.sem = 128

fs.file-max = 65536

net.ipv4.ip_local_port_range =

net.core.rmem_default =

net.core.rmem_max =

net.core.wmem_default =

net.core.wmem_max =

完成后,运行以下命令激活更改:

#sysctl–p

注:Linux

内核非常出色。与大多数其他 *NIX 系统不同,Linux

允许在系统启动和运行时修改大多数内核参数。完成内核参数更改后不必重新启动系统。Oracle 数据库 10g

需要以下所示的内核参数设置。其中给出的是最小值,因此如果您的系统使用的值较大,则不要更改它。

配置oracle用户的shell限制

#vi /etc/security/limits.conf 添加如下内容:

oraclesoft nproc 2023

oraclehard nproc

oraclesoft nofile 1024

oraclehard nofile 65536

#vi /etc/pam.d/login 添加如下内容:

session required pam_limits.so

导出x图形界面给oracle用户

由于安装时采用的是oracle的OUI图形化界面,需要X支持,而默认oracle用户是不支持图形化操作的,必须以root的身份导出X给oracle用户使用。运行如下命令:

#xhost +

access control disabled,clients can connect from any host

出现以上文字表示导出成功。

oracle用户下执行

1.2.1设置环境变量

#su –oracle

$vi .bash_profile

加入以下内容:

TMP=/tmp

TMPDIR=$TMP

ORACLE_BASE=/u01/app/oracle #oracle 根目录

ORACLE_HOME=$ORACLE_BASE/product/10.2.0/db_1 #oracle 家目录

ORACLE_SID=orcl #根据实际需要命名

LD_LIBRARY_PATH=$ORACLE_HOME/lib:/lib:/usr/lib

PATH=$ORACLE_HOME/bin:$PATH

exportTMP TMPDIR ORACLE_BASE ORACLE_HOME ORACLE_SID LD_LIBRARY_PATH PATH

$source .bash_profile#使环境变量生效

2、安装 Oracle

2.1、下载并解压oracle软件

从Oracle网站下载10201_database_linux_x86_32.cpio.gz到oracle用户家目录下/home/oracle/(也可为其他目录),使用oracle用户登录后,解压此文件:

$startx

$cd /home/oracle

$gunzip 10201_database_linux_x86_64.cpio.gz

$cpio -idmv selectopen_mode from v$database;

OPEN_MODE

—-

READ WRITE

若出现以上文字说明数据库正在正常运行。自此,数据库安装成功。

检查硬件是否满足要求

1)确保系统有足够的 RAM 和交换空间大小,运行以下命令:

#grep MemTotal /proc/meminfo

#grepSwapTotal /proc/meminfo

注:所需最小 RAM 为 512MB,而所需最小交换空间为 1GB。对于 RAM 小于或等于 2GB 的系统,交换空间应为 RAM 数量的两倍;对于 RAM 大于 2GB 的系统,交换空间应为 RAM 数量的一到两倍。

2)确保有足够的磁盘空间。Oracle 10g软件大约需要 2.5GB 的可用磁盘空间,数据库则另需至少1.2G的磁盘空间

3)/tmp 目录至少需要 400MB 的可用空间。

要检查系统上的可用磁盘空间,运行以下命令:

#df-h

检查系统是否已安装所需的开发包

使用rpm -qa命令,确保以下包已成功安装。对于包的版本,只有版本高于下面的都可以,如果低于此版本,则要升级处理,如下:

binutils-2.15.92.0.2-13.EL4

compat-db-4.1.25-9

compat-libstdc++-296-2.96-132.7.2

control-center-2.8.0-12

gcc-3.4.3-22.1.EL4

gcc-c++-3.4.3-22.1.EL44

glibc-2.3.4-2.9

glibc-common-2.3.4-2.9

gnome-libs-1.4.1.2.90-44.1

libstdc++-3.4.3-22.1

libstdc++-devel-3.4.3-22.1

make-3.80-5

pdksh-5.2.14-30

sysstat-5.0.5-1

xscreensaver-4.18-5.rhel4.2

setarch-1.6-1

libaio-0.3.103-3

创建oracle组和oracle用户

创建用于安装和维护 Oracle 10g软件的 Linux 组和用户帐户。用户帐户将称为 oracle,而组将称为 oinstall(用于软件安装) 和 dba(用于数据库管理)。

#groupadd oinstall

#groupadd dba

#useradd -m -g oinstall -G dba oracle –poracle (p表示添加帐号密码)

创建oracle目录并改变目录权弯穗棚限

现在,创建存储 Oracle 10g 软件和族携数据库文件的目录。本指南在创建目录结构时所用的命名惯例符合更佳灵活结构 (OFA) 规范。

以 root 用户身份执行以下埋则命令:

#mkdir -p /u01/app/oracle# oracle根目录,-p 表示递归建立目录

#mkdir -p /u02/oradata # oracle数据文件存放目录

#chown -R oracle:oinstall /u

#chown -R oracle:oinstall /u02

#chmod -R 775 /u01

#chmod -R 775 /u02

配置linux内核参数

#vi/etc/sysctl.conf,添加如下内容:

kernel.shmall =

kernel.shmmax =#此处默认设置为2G,数值一般设为物理内存的40~50%

kernel.shmmni = 4096

kernel.sem = 128

fs.file-max = 65536

net.ipv4.ip_local_port_range =

net.core.rmem_default =

net.core.rmem_max =

net.core.wmem_default =

net.core.wmem_max =

完成后,运行以下命令激活更改:

#sysctl–p

注:Linux 内核非常出色。与大多数其他 *NIX 系统不同,Linux 允许在系统启动和运行时修改大多数内核参数。完成内核参数更改后不必重新启动系统。Oracle 数据库 10g 需要以下所示的内核参数设置。其中给出的是最小值,因此如果您的系统使用的值较大,则不要更改它。

配置oracle用户的shell限制

#vi /etc/security/limits.conf 添加如下内容:

oraclesoft nproc 2023

oraclehard nproc

oraclesoft nofile 1024

oraclehard nofile 65536

#vi /etc/pam.d/login 添加如下内容:

session required pam_limits.so

导出x图形界面给oracle用户

由于安装时采用的是oracle的OUI图形化界面,需要X支持,而默认oracle用户是不支持图形化操作的,必须以root的身份导出X给oracle用户使用。运行如下命令:

#xhost +

access control disabled,clients can connect from any host

出现以上文字表示导出成功。

oracle用户下执行

1.2.1设置环境变量

#su –oracle

$vi .bash_profile

加入以下内容:

TMP=/tmp

TMPDIR=$TMP

ORACLE_BASE=/u01/app/oracle #oracle 根目录

ORACLE_HOME=$ORACLE_BASE/product/10.2.0/db_1 #oracle 家目录

ORACLE_SID=orcl #根据实际需要命名

LD_LIBRARY_PATH=$ORACLE_HOME/lib:/lib:/usr/lib

PATH=$ORACLE_HOME/bin:$PATH

exportTMP TMPDIR ORACLE_BASE ORACLE_HOME ORACLE_SID LD_LIBRARY_PATH PATH

$source .bash_profile#使环境变量生效

2、安装 Oracle

2.1、下载并解压oracle软件

从Oracle网站下载10201_database_linux_x86_32.cpio.gz到oracle用户家目录下/home/oracle/(也可为其他目录),使用oracle用户登录后,解压此文件:

$startx

$cd /home/oracle

$gunzip 10201_database_linux_x86_64.cpio.gz

$cpio -idmv selectopen_mode from v$database;

OPEN_MODE

—-

READ WRITE

若出现以上文字说明数据库正在正常运行。自此,数据库安装成功。

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